Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP1Q96S65 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms