Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85AQ96PX6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms