Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGAP1Q96PV0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms