Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZBED3Q96IU2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZBED3Q96IU2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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