Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms