Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAVIN3Q969G5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAVIN3Q969G5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms