Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms