Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCSTNQ92542 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCSTNQ92542 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms