Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00116Q8NCU8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00116Q8NCU8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms