Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT28Q7Z3Y7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms