Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PREX2Q70Z35 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PREX2Q70Z35 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PREX2Q70Z35 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PREX2Q70Z35 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PREX2Q70Z35 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms