Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INTS3Q68E01 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms