Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL1Q5VZK9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL1Q5VZK9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms