Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CEP170Q5SW79 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP170Q5SW79 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms