Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC93Q567U6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms