Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZC2HC1CQ53FD0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms