Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKIV2LQ15477 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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