Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCAPHQ15003 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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