Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFTN1Q14699 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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