Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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COL9A2Q14055 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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COL9A2Q14055 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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COL9A2Q14055 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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COL9A2Q14055 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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COL9A2Q14055 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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COL9A2Q14055 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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COL9A2Q14055 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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