Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDK13Q14004 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
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