Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX2Q13950 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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