Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCINQ13939 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCINQ13939 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCINQ13939 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCINQ13939 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
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