Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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