Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1SQ13698 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1SQ13698 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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