Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF6Q13247 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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