Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAF1AQ13111 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAF1AQ13111 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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