Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSME1Q06323 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms