Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XPCQ01831 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPCQ01831 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPCQ01831 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPCQ01831 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPCQ01831 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPCQ01831 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms