Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms