Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL23P55773 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL23P55773 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL23P55773 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL23P55773 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL23P55773 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL23P55773 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL23P55773 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL23P55773 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL23P55773 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL23P55773 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL23P55773 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL23P55773 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL23P55773 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL23P55773 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL23P55773 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL23P55773 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms