Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP7P55210 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP7P55210 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP7P55210 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP7P55210 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP7P55210 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP7P55210 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms