Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELLP55199 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELLP55199 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms