Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRAP54198 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRAP54198 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRAP54198 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIRAP54198 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIRAP54198 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms