Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIP4K2AP48426 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIP4K2AP48426 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms