Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PI4KAP42356 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PI4KAP42356 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms