Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MLH1P40692 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MLH1P40692 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MLH1P40692 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms