Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA1P25391 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms