Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MYF6P23409 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MYF6P23409 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYF6P23409 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYF6P23409 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYF6P23409 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYF6P23409 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYF6P23409 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYF6P23409 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYF6P23409 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYF6P23409 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYF6P23409 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYF6P23409 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYF6P23409 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms