Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA6P23229 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms