Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL1P22362 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL1P22362 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL1P22362 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL1P22362 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL1P22362 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL1P22362 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL1P22362 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL1P22362 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL1P22362 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms