Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNB1P20700 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNB1P20700 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms