Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL3P19876 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms