Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB4P16144 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms