Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSPP15924 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSPP15924 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSPP15924 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSPP15924 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSPP15924 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSPP15924 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms