Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFAP15692 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms