Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC175P0C221 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC175P0C221 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC175P0C221 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC175P0C221 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC175P0C221 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms