Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-7P01780 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-7P01780 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms