Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYF2O95926 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYF2O95926 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYF2O95926 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYF2O95926 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYF2O95926 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYF2O95926 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYF2O95926 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYF2O95926 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYF2O95926 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms