Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms